用胶囊装的药物，一般都是对食道和胃粘膜有刺激性的粉末或颗粒，或口感不好 、易于挥发、在口腔中易被唾液分解，以及易吸入气管的药。这些药装入胶囊，避开了水分、空气、光线的影响，对具不良嗅味或不稳定的药物有一定程度上的遮蔽、保护与稳定作用，既保护了药物药性不被破坏，也保护了消化器官和呼吸道。去掉胶囊壳可能会造成药物流失、药物浪费、药效降低。

另外，制成胶囊可延缓药物的释放和定位释药：可将药物按需要制成缓释颗粒装入胶囊中，达到缓释延效作用。如有些药物需要在肠内溶解吸收，胶囊是一种保护，保护药物不被胃酸破坏。

同时，胶囊剂的生物利用度较高。胶囊剂中的药物是以粉末或颗粒状态直接填装于囊壳中，不受压力等因素的影响，所以在胃肠道中迅速分散、溶出和吸收，其生物利用度将高于丸剂、片剂等剂型。一般胶囊的崩解时间是30分钟以内，片剂、丸剂是1小时以内。

部分药物如含油量高的药物或液态药物难以制成丸剂、片剂等，但可制成胶囊剂。